Kad se unesu sve stavke maloprodajnog računa, vrši se naplata i ispis računa pomoću gumba Total ili pritiskanjem funkcijske tipke <F10>. Nakon toga otvara se prozor za odabir načina plaćanja, prikazan na slici.
 
Prikazan je primjer gotovinskog plaćanja maloprodajnog računa s odabranim ispisom R1 računa. U ovom slučaju je kupac dao točno 11,00 Kn te nije potrebno vratiti ostatak novca. Na zaslonu za kupca (ukoliko je zaslon spojen na kasu) vidi se ukupni iznos kojeg kupac mora platiti.

Vrste plaćanja mogu biti:
Gotovina - plaćanje kovanicama ili novčanicama na prodajnom mjestu
Kartica - plaćanje kreditnom ili debitnom karticom na prodajnom mjestu. Ova opcija je dostupna ukoliko su u postavkama aplikacije upisane vrste kartica koje se prihvaćaju na prodajnom mjestu.
Čekovi - plaćanje čekovima građana na prodajnom mjestu
Virman - virmansko plaćanje računa izvršeno sa transakcijskog računa na transakcijski račun ili virmanskom uplatom na transakcijski računa prodavatelja
Zamjena - pod zamjenom se podrazumijeva zamjena vraćenih artikala, čiji račun je poništen, sa drugim artiklima unutar vrijednosti poništenog računa odnosno uz nadoplatu. Ova opcija trenutno nije omogućena.

Kombinirano plaćanje - maloprodajni račun može se platiti na više načina odjednom, na primjer: račun se može platiti dijelom u gotovini a preostali dio karticom: za ukupni iznos od 500,00 kn platiti 100,00 Kn u gotovini a 400,00 Kn kreditnom karticom. 

Nakon odabira svih potrebih načina plaćanja, za ispis računa kliknuti na gumb Ispis računa. Nakon toga softver se spaja na server Porezne uprave i šalje Zakonom propisane podatke o računu. U slučaju uspješnog spajanja na server i dobivenog JIR-a za maloprodajni račun sa strane Porezne uprave, JIR će se ispisati na računu. U slučaju neuspješnog spajanja na server Porezne uprave, prikazat će se odgovarajuća poruka na ekranu.

UPOZORENJE: obratite pažnju da na svakom izdanom računu bude ispisan JIR, odnosno pročitejte poruku koja se prikazala na ekranu u slučaju neuspješnog povezivanja sa serverom Porezne uprave, te poduzmite zakonski propisane korake u vezi naknadnog prijavljivanja računa i dobivanja JIR-a za iste.

Za vrijeme spajanja na server Porezne uprave i ispisivanja računa, na ekranu će biti vidljiva poruka o iznosu gotovine koji je potrebno vratiti kupcu. Prozor s nazivom Ostatak je prikazan na slici.
 
U primjeru je kupac platio točan iznos i nije mu potrebno vraćati gotovinu.

Ukoliko je na blagajnu spojena ladica za novac, ona se automatski otvara i omogućuje polaganje uplaćenog iznosa, povrat ostatka gotovine kupcu te umetanje slipova i čekova na odgovarajuća mjesta.

Na slici je prikazan primjer gotovinskog plaćanja maloprodajnog računa.

U polje Iznos na kartici Gotovina treba upisati iznos gotovine koji je kupac dao blagajniku. Ukoliko je za cjelokupni iznos računa definirano plaćanje gotovinom, u polju Preostaje za naplatu biti će iznos: 0,00 kn. Nakon toga može se nastaviti s ispisom računa klikom na gumb Ispis računa. Ukoliko je na blagajnu spojen zaslon za kupca, iznos za vraćanje gotovine će se pojaviti i na njemu. 

Ukoliko je korisničkim postavkama upisana barem jedna vrsta kartice, moguće je izvršiti plaćanje računa karticom. 
 

Na stranici Kartica potrebno je odabrati vrstu kartice, upisati broj kartice i naplaćeni iznos putem kartice. Aplikacija prilikom prve promjene sa stranice Gotovina za gotovinsko plaćanje na bilo koju drugu stranicu, automatski iznos gotovinskog plaćanja izbriše i cjelokupni iznos plaćanja preseli na upravo otvorenu stranicu.
Ukoliko je za cjelokupni iznos računa definirano plaćanje karticom, u polju Preostaje za naplatu biti će iznos: 0,00 kn. Nakon toga može se nastaviti s ispisom računa klikom na gumb Ispis računa.

Na stranici Čekovi namijenjenoj naplati putem čekova građana, mogu se upisivati osnovni podaci: IBAN i OIB kupca, broj rata - ukupni broj čekova, te polje u koje možete upisati serijske brojeve čekova, datume naplate i broj tekućeg računa. Ukoliko je instalirana aplikacija za specifikaciju čekova, tada je moguće upisati i datum naplate pojedinog čeka.

Ukoliko je za cjelokupni iznos računa odabrano plaćanje čekovima, u polju Preostaje za naplatu biti će iznos: 0,00 kn. Nakon toga može se nastaviti sa ispisom računa klikom na gumb Ispis računa.

Na stranici Virman upisuje se iznos računa koji je plaćen uplatom kupca na transakcijski računi prodavatelja.

U polje Poziv na broj plaćanja upisuje se poziv na broj plaćanja vidljiv na Izvodu s transakcijskog računa. Aplikacija sama postavlja predefiniranu vrijednost ovog polja. U polje Iznos upisuje se iznos uplaćen na transakcijski račun prodavatelja.

Ukoliko je za cjelokupni iznos računa odabrano plaćanje virmanom, u polju Preostaje za naplatu biti će iznos: 0,00 kn. Nakon toga može se nastaviti sa ispisom računa klikom na gumb Ispis računa.

Za ispis R1 računa (odnosno R2 za obrtnike) potrebno je uključiti gumb R1/R2, kao što je prikazano na slici. 

Nakon odabira načina plaćanja, za ispis računa treba kliknuti na gumb Ispis računa ili pritisnuti funkcijsku tipku <F10>. Otvorit će se prozor za odabir kupca prikazan na slici.

Kupca koji se nalazi u popisu adresa dovoljno je izabrati i dva puta kliknuti pokazivačem miša odnosno kliknuti na gumb U redu ili pritisnuti tipku <ENTER>. Ako se kupac ne nalazi u popisu adresa, nova adresa se može dodati tako da se klikne na gumb Nova adresa.

U prozoru za unos nove adrese potrebno je upisati barem naslov kupca, OIB, adresu i grad. Nakon unosa podataka novog kupca, s ispisom računa nastavlja se pomoću gumba U redu ili tipke <ENTER>.